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BIG DATA & Bioinformatique
Big Data
- Le Volume de l’ordre des terabytes (1012) (TB), petabytes (1015) (PB) et même zettabytes (1021)
- La Variété représentant l’hétérogénéité des données
- La Vélocité réprésentant la vitesse à laquelle sont générées et sont analysées les données.
Bio-informatique
La bioinformatique est constituée par l’ensemble des concepts et des techniques nécessaires à l’interprétation de l’information génétique (séquences) et structurale (repliement 3D).
C’est le décryptage de la “bio-information” c’est la “Computational Biology” en anglais ou Bio-computing.
La bioinformatique est donc une branche théorique de la biologie (Claverie).
La bioinformatique couvre également un autre domaine de la biologie dite in silico, correspondant à une modélisation du vivant et plus proche du terme anglais “bioinformatics”.
Data-visualisation
La visualisation des données (ou dataviz ou représentation graphique de données) est un ensemble de méthodes permettant de résumer de manière graphique des données. La visualisation de données fait partie de la science des données.
Spécialiste à la fois des données et du graphisme, Anaximandre exploite vos données pour en obtenir la représentation la meilleure, et donnant l’information la plus pertinente.
La Data Visualisation est une étape importante du processus de l’analyse de données.
Méthodologie
- Analyse des données (format, sources, …)
- Collecte ou synchronisation des données
- Définition de la représentation des données en fonction de l’information recherchée
- Représentation dynamique des données
- Mise en place de l’interactivité
- Mise en ligne
Valeur ajoutée
Une partie du travail en bioinformatique ou Big Data d’Anaximandre consiste à prolonger la compétence de communication scientifique ou à participer au travail de recherche d’un projet collaboratif ou européen.
Les différentes spécialités en Big Data / bioinformatique et datavisualisation d’Anaximandre tournent autour de 5 compétences :
- La modélisation moléculaire et le docking à partir de fichiers PDB
- Compilation de données scientifiques et extraction d’informations pertinentes
- Le développement à façon d’applications pour les biotechnologies et les laboratoires pharmaceutiques
- La modélisation de processus biologiques
- La Datavisualisation